Ve Sněmově dohodu kritizovali hlavně poslanci KSČM a přednášeli k ní rozsáhlé kritické projevy. Ministr průmyslu a obchodu Jiří Havlíček (ČSSD) naopak dohodu hájil. Podle něj je výsledek vyjednávání o dohodě pro ČR příznivý. Dohoda podpoří český export a otevírá českým firmám přístup k veřejným zakázkám na federální i obecní úrovni v Kanadě, argumentoval. CETA by podle odhadů expertů mohla přinést nárůst obchodní výměny mezi EU a Kanadou až o pětinu. Unie odhaduje, že aplikace smlouvy by zvýšila vzájemnou obchodní výměnu až o 324 miliard korun ročně, má také podpořit hospodářský růst a pomoci vytvářet nová pracovní místa. Kritici ale tvrdí, že může ohrozit tisíce pracovních míst, což však podle unijních expertů vyvrací několik nezávislých studií.

Pro dohodu hlasovalo 85 ze 132 přítomných poslanců. Proti ratifikaci byli hlavně komunisté. K nim se přidali dva sociální demokraté, čtyři poslanci klubu ANO a čtyři nezařazení poslanci.

Podle poslanců KSČM není dohoda v zájmu ČR a není pro Česko výhodná. Poukazovali například na rizika pro postavení českých spotřebitelů. Uváděli například že CETA zohledňuje především zájmy nadnárodních společností a představuje riziko i pro mnoho veřejných zájmů.

Výhrady zazněly i od poslanců z klubu ANO. Poslanec Pavel Plzák v souvislosti se smlouvou varoval například před zřízením zvláštního investičního soudu, který bude řešit spory mezi firmami a státy. Podotkl, že firmy budou moci státy žalovat i za poškození oprávněných očekávání, ale závazky investorů by přes tento soud vymahatelné nebyly. „Myslím, že toto je opravdu nebezpečné," řekl Plzák. Podpořil ho jeho stranický kolega Bohuslav Chalupa; nikdo podle něho není schopen vysvětlit dopady smlouvy. Ministr financí Ivan Pilný (ANO) kritiku odmítl a lékaři Plzákovi vzkázal, aby se držel svého kopyta. Některé jeho argumenty označil za „blábol".