Havel vystudoval Elektrotechnickou fakultu ČVUT v Praze a poté studoval i ve Spojených státech, kde získal doktorát.

Za normalizace byl organizátorem bytových seminářů zaměřující se na vědu a filozofii. Podílel se také na vydávání samizdatové literatury. Následně se během sametové revoluce s bratrem Václavem Havlem angažoval v Občanském fóru.

Poté působil na Matematicko-fyzikální fakultě Univerzity Karlovy a zastával funkci ředitele Centra pro teoretická studia. Rovněž byl šéfredaktorem časopisu Vesmír. Zabýval se zejména studiem kybernetiky, robotiky a umělé inteligence.