VV chtějí církve zrušit ze seznamu poplatníků, kteří nebyli založeni za účelem podnikání a u nichž jsou předmětem daně z příjmů pouze příjmy z případných podnikatelských aktivit, z pronájmu a z reklam. Zdůvodňují to tím, že církve získají v rámci restitucí rozsáhlý majetek a budou tedy provozovat i ekonomickou činnost a tím generovat zisky. Není prý tedy důvod je pro účely zdanění považovat za neziskové subjekty.

Novela Věcí veřejných souvisí s jejich nesouhlasem s církevními restitucemi

Návrh stanoviska ale namítá, že samotné vyjmutí církví by pro ně neznamenalo změnu daňového režimu, protože jejich hlavní činností nebude nikdy podnikání. Zrušení výjimky by tak prý pouze umožnilo církvím kompenzaci ztrát prostřednictvím příjmů z případného podnikání, z pronájmu a z reklam.

Pouze takovéto příjmy také církve nebo jiné neziskové organizace musí nyní zdanit. Příjmy církví z jejich hlavní činnosti by byly zdaňovány pouze v případě, pokud by byly vyšší než s nimi související výdaje.

Novela Věcí veřejných souvisí s jejich nesouhlasem s církevními restitucemi. Když se jim nepodařilo zabránit schválení vládního zákona o majetkovém vyrovnání státu s církvemi v parlamentu, pokusili se normu zrušit prostřednictvím Ústavního soudu. Ten ale jejich požadavku nevyhověl.