V prostorách ústavu najdou pacienti všechny chirurgické obory, gynekologii a urologii. Unikátní je zdejší přístrojové vybavení, které dosahuje nejvyšší evropské úrovně. Chirurgové v ústavu provedou 3800 operací za rok. Na Žlutém kopci nechybí anesteziologicko-resuscitační oddělení nebo oddělení intenzivní péče, kde jsou nemocní se sníženou imunitou dokonale izolováni od okolního prostředí. Zázemí tam získali rovněž patologové, neboť výsledky jejich práce jsou často stěžejní právě pro chirurgy. U onkologických operací je totiž ve většině případů nutné co nejdříve prozkoumat, zda odebraná tkáň má zhoubný, či nezhoubný charakter. Soustředění všech příbuzných oborů pod jednu střechu má velký význam pro lékaře i pacienty.
Masarykův onkologický ústav se zabývá léčbou zhoubných nádorových onemocnění na světové úrovni. Má dva platné certifikáty kvality, v roce 2010 získal certifikát Spokojený pacient jako jediné zdravotnické zařízení v Brně a jako jediné pracoviště v České republice je členem Organizace evropských onkologických ústavů.
„Mohl jsem se přesvědčit o tom, že Brno je kvalitním a úspěšným centrem léčby rakoviny v České republice, které mění osudy pacientů. Je potřeba připomenout, že široce vžitý a stále hojně užívaný pojem rakovina považují onkologové za nešťastný. Odjakživa ho totiž obklopuje představa nevyléčitelnosti a neodvratné smrti, které předcházejí kruté bolesti a všelijaká jiná utrpení. Ač tomu tak už delší dobu není, obestírá nádorová onemocnění mýtus, jehož vyvrácení je jedním z hlavních, přitom však velmi obtížně řešitelných úkolů současných onkologů. Rád bych, aby tento mýtus, i díky úspěchům léčby brněnských onkologů, zmizel,“ uvádí primátor Roman Onderka.
Masarykův onkologický ústav za součást svého komplexního přístupu k onkologickým onemocněním považuje také povinnost věnovat se osvětě. Proto bylo v jeho prostorách založeno Onkologické informační centrum, které dodnes zůstává jediným svého druhu v České republice. Jeho služeb už využilo přibližně 46 tisíc pacientů, jejich rodinných příslušníků i veřejnosti.
