V reakci na slova Romana Onderky, který v Otázkách Václava Moravce na ČT prohlásil, že ministr spravedlnosti podal demisi ze zdravotních důvodů, uvedl Jan Kněžínek: „Zásadně se ohrazuji proti tvrzením o demisi ze zdravotních důvodů. Jsem, s výjimkou vyššího zdravotního tlaku, zcela zdráv.“
Jan Kněžínek oznámil, že se rozhodl podat demisi na funkci ministra spravedlnosti ke dni 30. dubna 2019. Své rozhodnutí dlouho zvažoval. „Přijde mi logické odejít v okamžiku, kdy zároveň dochází i k výměnám jiných ministrů,“ uvedl mj. v prohlášení z 18. dubna 2019.