Parlamentní kontrolu činnosti zpravodajských služeb České republiky v prvním stupni kontroly bude i nadále vykonávat Poslanecká sněmovna Parlamentu ČR prostřednictvím svých zvláštních kontrolních orgánů, složených z poslanců.
Kontrola činností Bezpečnostní informační služby a Vojenského zpravodajství Poslaneckou sněmovnou bude v zásadě převzata z dosavadní právní úpravy a nově bude zavedena parlamentní kontrola činnosti Úřadu pro zahraniční styky a informace prostřednictvím zvláštního kontrolního orgánu, vytvořeného obdobným způsobem jako kontrolní orgány pro činnost BIS a Vojenského zpravodajství.
Kontrolu činnosti zpravodajských služeb ve druhém stupni kontroly by měl vykonávat jednotný kontrolní orgán 2. stupně, který bude tvořit pět osob zvolených na dobu pěti let Poslaneckou sněmovnou z řad soudců nebo bývalých soudců vyšších obecných soudů nebo bývalých soudců Ústavního soudu, které navrhne vláda.