V roce 1994 přistoupila naše země k Partnerství pro mír (Partnership for Peace) a naše armáda pokračovala v restrukturalizaci armády a v přípravě na budoucí vojenskou spolupráci s NATO (North Atlantic Treaty Organization). Zkušenosti získané v zahraničních misích i při likvidaci následků ničivých povodní, postupná modernizace armády, změny ve velení a struktuře Armády České republiky vedly ke splnění požadavků na přistoupení k Alianci. To se uskutečnilo 12.3.1999, kdy byla Česká republika přijata za člena NATO.
Ve stejném roce se česká armáda poprvé zapojila v souladu s článkem 5 Washingtonské smlouvy do mezinárodní operace Trvalá svoboda (Enduring Freedom) v Kuvajtu a mírové operace ISAF (International Security Assistance Forces) v Afghánistánu. Významnou událostí byl v roce 2002 Pražský summit NATO, který specifikoval takzvané Pražské závazky (Prague Capabilities Commitment), které se staly základem pro pozdější Smart Defence.
Předělem ve výstavbě armády bylo schválení koncepce výstavby profesionální armády v listopadu roku 2003 a její uskutečnění k 1.1.2005. Hlavním cílem reformy bylo zvýšení schopností ozbrojených sil při zabezpečování obrany státu a pro plnění si závazků vyplývajících z členství v Alianci. Cílovým stavem při dosažení úplných operačních schopností mělo být 35 000 osob, z toho 26 200 profesionálních vojáků s patřičnou výzbrojí, výstrojí a technikou. K tomu ovšem byly zapotřebí nezbytné finanční zdroje s odhadovanou výší dvou procent hrubého domácího produktu. Po deseti letech reformy tyto výdaje dosahují pouze poloviny této hodnoty. Skutečný počet osob je 30 158, z toho vojáků z povolání necelých 22 000.
Dlouhodobě krácené obranné výdaje si vyžádaly k lednu tohoto roku novou organizační strukturu, restrukturalizaci generálního štábu, vznik nových malých velitelství vzdušných a pozemních sil, vytvoření nových agentur po vzoru armád NATO a změny branných zákonů. Česká armáda se výrazně zapojuje do iniciativ Smart Defence a Connected Forces. Zároveň podporuje vojenskou spolupráci v evropské iniciativě Pooling and Sharing. Pokračuje v modernizaci svých jednotek a v působení v zahraničních misích v Afghánistánu, Mali, Kosovu, Kongu či v misi MFO (Multinational Force and Observers). České vzdušné síly jsou součástí NATINAMDS (NATO Integrated Air and Missile Defence System), pravidelně se zapojují do ochrany vzdušného prostoru v misích Air Policing.
V rámci strategie moderní obrany je naše armáda zapojena v projektu MATC (Multinational Aviation Training) úspěch slaví MLCC (Multinational Logistic Coordination Centre) zahrnující mezinárodní spolupráci v JLSG (Point Logistic Support Group), české ozbrojené síly jsou zapojeny v projektu Mnohonárodnostního praporu vojenské policie a v C-IED COE (Counter Improvised Explosives Device Centre of Excellence). Spolupráce probíhá ve specializaci na chemickou, biologickou a radiační ochranu v rámci Combinated Joint CBRN Task Forces a ve výcviku nových vojáků. Česká republika je zapojena do NRF (NATO Response Force) a v Battle groups Evropské unie. Spolupracujeme na vytváření kapacit pro kybernetickou bezpečnost a rozvíjíme schopnosti speciálních sil. Posilujeme obranné plánování, výcvik jednotek a pracujeme na dlouhodobém výhledu pro obranu.
Česká republika je 15 let členem Severoatlantické aliance a rozvíjí transatlantickou spolupráci. Přes všechny problémy pokračuje v budování efektivní, akceschopné a moderní profesionální armády. Armády, která se i přes snížený finanční rámec snaží plnit si své závazky pro zvyšování svých schopností podle čl.3 Washingtonské smlouvy a podle svých možností se zapojuje do společné obrany Aliance i Evropské unie. Společnou snahou je docílit stability a bezpečnosti v dnes konfliktních regionech severní Afriky a na Středním Východě. Důležité je pokračovat v budování demokratických a právních států na Balkáně. Poslední události na Ukrajině a bezprecedentní postup Ruské federace při okupaci Krymu ukazují, že bezpečnost naší země není samozřejmostí. Pouze větší politická odpovědnost za budování svých vojenských schopností, efektivní a vzájemná mezinárodní spolupráce, udržení a rozvoj transatlantické vazby umožní účinně čelit současným bezpečnostním hrozbám
