Mezi nejvýznamnější systémové nedostatky ve výkonu činností některých kontrolovaných osob v roce 2013 patřily například:
• nehospodárnost a neefektivita při výběru některých příjmů státu a nízká efektivita při vymáhání daňových nedoplatků;
• nedostatečné nastavení a vyhodnocování cílů dotačních titulů a nedodržování pravidel, zásad a transparentnosti při poskytování dotací;
• chyby v přípravě a realizaci projektů ICT, potlačování vlivu soutěžního prostředí a vznik závislosti na jednom dodavateli;
• přenos některých činností státu na externí právní, poradenské a konzultační subjekty vedoucí k nehospodárnostem;
• nákupy materiálu bez výběrových řízení a písemně uzavřených smluv s důsledkem značných cenových rozdílů;
• nedostatečný výkon majetkových práv státu;
• neúčinnost dosavadních opatření a mechanismů k zefektivnění výstavby dopravní infrastruktury;
• selhávání programového financování, které nezajišťuje pevný časový ani finanční rámec s vyhodnotitelnými cíli a efekty investiční politiky státu;
• nedostatečná funkčnost řízení a kontroly některých programů spolufinancovaných z prostředků EU a zaostávání jejich čerpání;
• nespolehlivost vykazovaných údajů státu pro monitoring a řízení veřejných financí ve vazbě na nedostatky účetní reformy státu.
NKÚ už také několikrát podal trestní oznámení na různé případy a třeba v roce 2012, kdy byly příjemcům podpory proplaceny dotace v souhrnné výši 1.799.188 korun na pokrytí úhrad a dodávek, které nebyly realizovány nebo nebyly součástí projektu, byl tento případ ze strany policie 6x odložen. V roce 2013 zas bylo policií odloženo trestní oznámení ze strany NKÚ v případě, kdy příjemcům dotace byly proplaceny příspěvky v souhrnné výši 7.635.795 korun na pokrytí úhrad nezpůsobilých výdajů. Z těchto důvodů se prezident NKÚ Miloslav Kala obrátil na nejvyššího žalobce Pavla Zemana, aby znovu posoudil a otevřel některé kontrolované kauzy. Prezident Kala k tomu řekl: „Je pro mě velkým zklamáním, jak snadno a rychle policie naše trestní oznámení podložená kontrolními zjištěními uložila k ledu. Nejvyšší kontrolní úřad chce svou práci dotahovat do konce.“
Z těchto stále se opakujících zjištění je zřejmé, že si platíme z našich daní NKÚ úplně zbytečně. Pokud se uvedené kauzy budou i nadále zametat pod koberec a nebudou se řešit, je NKÚ a jeho aparát úplně zbytečný. Jsem přesvědčen o tom, že pokud nebude v naší zemi zavedena osobní, hmotná a trestní odpovědnost politiků a veřejných představitelů se zavedením povinnosti starat se o svěřený majetek a finance s péčí řádného hospodáře, budou se uvedené kauzy dále odkládat a výroční zprávy NKÚ budou stále stejné!
