Nejvyšší kontrolní úřad prověřil, jak Ministerstvo zahraničních věcí (MZV) vedlo účetnictví v průběhu roku 2015. Kontroloři se zaměřili na to, jestli bylo účetnictví správné, úplné, průkazné a srozumitelné a zda odpovídalo zákonu. Nesprávnosti, které kontrola v účetnictví našla, dosáhly téměř 2,7 miliardy korun. Vznikly zejména kvůli chybnému účtování účetních případů zastupitelských úřadů, podmíněných závazků z transferů a prostředků na financování záloh zastupitelských úřadů. Podle kontrolorů jsou celkové nesprávnosti významné a MZV tak v roce 2015 vedlo nesprávné, neúplné, neprůkazné a nesrozumitelné účetnictví.

MZV podle kontrolorů neúčtovalo za zastupitelské úřady průběžně, ale jednorázově. Dvěma doklady tak zaúčtovalo 302 tisíc účetních zápisů. Ty přitom tvořily 59 % všech účetních zápisů ministerstva v roce 2015. Navíc tyto doklady nesplňovaly zákonné náležitosti účetních dokladů a nebylo z nich tak zřejmé, čeho se týkají.

Ministerstvo také pro zastupitelské úřady místo kalendářního roku nesprávně stanovilo účetní období od listopadu 2014 do října 2015. Zbytek roku 2015 účtovalo MZV jen o jejich nákladech.

Kontroloři zjistili i další systémové chyby. Ministerstvo například nerozlišovalo mezi hotovostními a bezhotovostními pohyby peněžních prostředků. Všechny hotovostní operace na zastupitelských úřadech účtovalo, jako by šlo o bezhotovostní pohyby na bankovních účtech. Ve výsledku proto stav peněžních prostředků na účtech zastupitelských úřadů nesouhlasil se zůstatky uvedenými ve výpisech z účtů.

Ministerstvo také chybně účtovalo o prostředcích na financování záloh zastupitelských úřadů za 200 milionů korun. Vykázalo je totiž jako závazek vůči jinému subjektu, i když je jen převádělo mezi svými vlastními bankovními účty.

V knihách podrozvahových účtů MZV neúčtovalo o dlouhodobých podmíněných závazcích ze zahraničních transferů nebo z jiných smluv. V roce 2015 tak v účetnictví například nevykázalo podmíněné závazky za více než 1,4 miliardy korun vyplývající z povinností daných ministerstvu vládou. Jednalo se například o platby příspěvků mezinárodním organizacím, v nichž je ČR členem.