V roce 2016 vykázala TOP 09 ztrátu zhruba 18 milionů korun. Informovala tehdy, že ztrátové hospodaření způsobily náklady na krajské a senátní volby. Deficit vykryly úspory z předchozích let. Také nyní strana uvádí, že i přes negativní poměr výnosů a nákladů loni hospodařila bez dluhů.

Příjmy TOP 09 podle výroční zprávy dosáhly na 94,7 milionu korun, nejvýrazněji se na tom podílely příspěvky ze státního rozpočtu. Na úhradu volebních nákladů a činnost strany dostala TOP 09 dohromady 67,9 milionu korun. Přijala také přes tisíc darů, nejvíc přispěl čestný předseda Karel Schwarzenberg, který zaslal na účet strany 1,05 milionu.

Volby do Sněmovny vyšly stranu na 74,8 milionu, senátní kampaň pak vyúčtovala TOP 09 na něco přes 39.000 korun. Na volební náklady si vypomohla strana úvěrem ve výši 9,1 milionu, který za měsíc splatila, stojí v tiskové zprávě. „TOP 09 se po celých devět let od svého vzniku chová jako odpovědná strana. Vážíme si každého daru, nejen od našich sympatizantů, ale i od členů a s jejich penězi zacházíme naprosto transparentně,“ uvedla generální sekretářka TOP 09 Marcela Masná.