Jedná se o další velice cennou část brněnského podzemí, které by veřejnosti mohlo být zpřístupněno za cca devět měsíců. Předmětem díla je rekonstrukce prostoru, nové zpřístupnění (vytvoření schodiště), vytvoření sociálního zázemí (toalety, prodej lístků).
Stavba bude členěna na čtyři části:
1. Vstupní objekt
Kostnice u sv. Jakuba byla v době, kdy sloužila k ukládání kostí, přístupná pouze schodištěm, krytým kamennou deskou. Deska se nachází uprostřed kostelní lodi. Tento vstup do kostnice nelze z technických ani praktických důvodů použít. Po dohodě Magistrátu města Brna a svatojakubské farnosti bylo jako nejoptimálnější řešení zvoleno umístění vstupu mimo objekt kostela – přímo z náměstí v prostoru chodníku a parkoviště aut. Tento vstupní objekt bude řešen jako schodiště, kryté z jižní strany kamennou zdí, založenou na ŽB základě, a ze severní strany kovaným zábradlím. Kamenná zeď, vystupující na úroveň náměstí do výše tří metrů, bude provedena z ocelové konstrukce, na kterou budou zavěšeny kamenné pláty z božanovského pískovce. Jižní strana kamene bude výtvarně pojednána tesanými reliéfy pěti svatých, kteří měli přímou vazbu na kostel sv. Jakuba (sv. Mořic, sv. Uršula (Voršila), sv. Dorota, sv. Konstantin a sv. Primitivus). Sv. Konstantin a sv. Primitivus jsou zároveň patrony města Brna a jejich ostatky byly uloženy v 18. stol. v kostele sv. Jakuba. Na severní straně bude vytesán text (žalm), který bude obsahovat latinský nápis a jména významných brněnských rodů i osobností spjatých s historií kostela i svatojakubské farnosti.
2. Vstupní hala
Vstupní hala bude nově vytvořeným podzemním prostorem kostnice. Umožní nejen vstup do historických prostor, ale bude vybavena i provozním a technickým zařízením, nezbytně nutným pro realizaci záměru zpřístupnění. Bude zde umístěno pohotovostní hygienické zázemí (umyvadlo, WC a výlevka), elektrorozvaděč, úklidová komora a místnost pro prodej vstupenek. Vstup do haly bude umožněn dvoukřídlovými vstupními dveřmi. Prostor vstupní haly bude vybaven sedátkem, informačními tabulemi s podsvícením, popiskami fragmentů a exponátů a uměleckým dílem (socha Chárona – syna boha věčné tmy a bohyně noci – převozníka zemřelých do podsvětí).
3. Expozice pod náměstím
Část historické kostnice, která je situována pod náměstím, byla v roce 2001 až 2002 částečně upravena již se záměrem budoucího zpřístupnění. Sestává se z chodby, kostniční komory a odbočující nedokončené chodby. V této části kostnice, v blízkosti základové zdi kostela, je také umístěn prozatímní vstup do kostnice. V rámci zpřístupnění kostnice bude i v této části provedeno množství nezbytných stavebních i technických úprav a opatření. Uložení kostí bude ponecháno ve stávajícím stavu. Kostniční komora bude vybavena kovanou zábranou proti přístupu k ostatkům (bude provedena jako odnímatelná zábrana pro případné technické úpravy). Schodiště se třemi stupni z cihel v chodbě bude opatřeno kovaným zábradlím. Expozice bude vybavena dvěma výtvarnými díly.
4. Expozice pod kostelem
Část historických prostor situovaných pod kostelem je v současnosti tvořena třemi komorami kostnice, vyplněnými lidskými ostatky (cca ze dvou třetin objemu). Zde je potřeba provést nejvíce úprav a opatření, které povedou ke stavebnímu statickému zajištění tak, aby zde mohla vzniknout zamýšlená expozice. V první fázi bude nutné provést hygienická opatření a průzkum, následovat bude antropologický průzkum, dále bude probíhat monitoring stavu stavebních konstrukcí, po vyklizení celého prostoru krypty od ostatků bude proveden stavebněhistorický průzkum, bude proveden průzkum a identifikace historického odvodňovacího a odvětrávacího systému krypty.
