Opírala se při tom o stanovisko nejvyššího státního zástupce Pavla Zemana, který výslovně označil závěr krajského úřadu za nesprávný. Podle ministerstva však protikorupční organizace neuvedla v podnětu žádné nové poznatky. Podle zákona jí tak ministerstvo ani vyhovět nemohlo, uvedl v tiskové zprávě mluvčí úřadu Vladimír Řepka.

Organizace podle ministryně spravedlnosti Marie Benešové (za ANO) připravila podnět "s neznalostí zákona". "Je s podivem, že právníci této organizace nevědí, že kdybychom vyhověli jejich požadavku, porušili bychom zákon," uvedla.

Středočeský kraj byl odvolacím orgánem ve správním řízení, které se týkalo údajného Babišova přestupku proti zákonu o střetu zájmů. Premiér čelil podezření, že stále ovládá média ze skupiny Mafra spadající pod holding Agrofert, který v roce 2017 vložil do svěřenských fondů. Podle zákona o střetu zájmů nesmí politici vlastnit periodický tisk.

Kraj rozhodl, že Babiš ve střetu zájmů není. Zeman počátkem srpna uvedl, že podle něj má premiér nadále rozhodující vliv na firmy z holdingu Agrofert. Správní žalobu ale nepodal, protože ve věci neshledal veřejný zájem. Protikorupční organizace pak vyrozumění NSZ připojila ke svému podnětu na přezkum kauzy.

Ministerstvo spravedlnosti však podle Řepky dospělo již v říjnu 2019 k závěru, že rozhodnutí odvolacího správního orgánu nebylo vydáno v rozporu s právními předpisy. Podnět již jednou posuzovalo, v srpnu se na něj organizace obrátila již podruhé. Nepřineslo ale podle něj "žádné nové poznatky o pravomocně skončené věci".

Městský úřad v Černošicích, který byl v první instanci k případu příslušný kvůli premiérovu místu bydliště, střet zájmů u Babiše shledal a vyměřil mu loni v lednu pokutu. Babišovi právníci se odvolali a krajský úřad Středočeského kraje dospěl k názoru, že přestupek se nestal a řízení pravomocně zastavil.

Premiér vždy obvinění ze střetu zájmů odmítal. Tvrdil, že vložením Agrofertu do svěřenských fondů zcela ztratil vliv na holding i na všechny společnosti, které jsou do něj začleněné.