Vláda Andreje Babiše na schůzi v pondělí 3. prosince 2018 schválila návrh novely zákona o Nejvyšším kontrolním úřadu. Jejím cílem je rozšířit omezený rozsah kontrolní působnosti úřadu. Řešila se i situace ohledně domnělého střetu zájmů premiéra ČR v souvislosti se stanoviskem Evropské komise. Vláda schválila také převedení agendy boje proti korupci z Úřadu vlády na Ministerstvo spravedlnosti. Zabývala se i šesti poslaneckými návrhy.

V případě domnělého střetu zájmů předsedy vlády předložila ministryně pro místní rozvoj Klára Dostálová informaci týkající se čerpání dotací, které spadají do svěřeneckého fondu společnosti Agrofert. Ministryně pro místní rozvoj ve spolupráci s ministerstvy financí a spravedlnosti připravila stanovisko, podle kterého není zřejmé, z jakých důvodů by mělo být na předsedu vlády nahlíženo jako na osobu podílející se na plnění rozpočtu EU, protože nerozhoduje o jejich udělování a ani se nepodílí na jejich kontrole a auditu. „Česká republika žádné dotace vracet nebude, protože k tomu není nejmenší důvod. Nemáme žádné stanovisko Evropské komise, byl zveřejněn interní materiál. Nebudu hovořit o načasování, protože právě dnes bude Evropská Unie řešit rozpočet a nepochybuji, že různí europoslanci to znovu využijí k napadání mé osoby,“ uvedl premiér Babiš.

Vláda schválila návrh novely zákona o Nejvyšším kontrolním úřadu, jejímž cílem je rozšířit dosavadní omezený rozsah kontrolní působnosti. Dosud může úřad provádět kontrolu hospodaření jiných subjektů než státu, tzn. jiných osob, včetně obcí a krajů jen v případě, kdy hospodaří se státním majetkem včetně finančních prostředků. Podle vlády nemůže Nejvyšší kontrolní úřad v tuto chvíli beze zbytku naplňovat svou ústavní roli, tedy přinášet občanům prostřednictvím Parlamentu České republiky informace o způsobu nakládaní s veřejnými prostředky. Vláda navrhuje rozšíření kontroly Nejvyššího kontrolního úřadu na územní samosprávné celky. Návrh má pomoci udržet zdravé veřejné finance a jeho pomocí chce vláda naplnit své Programové prohlášení a započít reformu se zaměřením na efektivní využívání veřejných prostředků.