Evropská komise pozastavila platební lhůtu pouze na tuto jednu dílčí žádost týkající se projektu společnosti Fatra a.s., nikoli ostatní prostředky z Evropských strukturálních a investičních fondů. Díky tomuto dopisu tak Česká republika získala žalovatelný akt, který bude moci být Českou republikou napaden s cílem získat rozsudek Soudního dvora EU. Důvodem pro předložení žádosti byl opakovaně prezentovaný nesouhlasný postoj České republiky ke zjištění Evropské komise ve věci střetu zájmů, uvedeném v auditní zprávě vztahující se k této problematice.

Jak žádost České republiky, tak aktuální odpověď Evropské komise, odpovídají předem konzultovanému a národními orgány opakovaně prezentovanému postupu. Informace v některých médiích, že reakce Evropské komise je z hlediska ČR neúspěchem, nebo že znamená stopku pro jakékoliv další platby z prostředků EU, se nezakládají na pravdě a nemají oporu ve znění dopisu ze strany EK. Naopak, reakce Evropské komise tyto obavy vyloučila, neboť došlo k pozastavení právě a jen platby projektu společnosti Fatra a.s.

Další postup bude koordinován společně s Ministerstvem průmyslu a obchodu jako řídícím orgánu Operačního programu podnikání a inovace pro konkurenceschopnost a Ministerstvem zahraničních věcí, které by Českou republiku v daném sporu zastupovalo.