Dohoda má za cíl v souladu s požadavky potravinového práva EU a platných předpisů ČR zajistit odpovídající ochranu zájmů tuzemských spotřebitelů a aplikovat vhodná opatření u potravin, které by mohly přestavovat riziko pro jejich zdraví.

Současná verze dohody navazuje na verzi z roku 2014 a reflektuje změny právních předpisů, které za poslední období vešly v platnost. Dále upravuje možnosti provedení společných kontrolních akcí, které jsou zaměřené na aktuální problémové oblasti na trhu, včetně případných společných vnitrostátních kontrol.

Spolupráce obou dozorových orgánů je dlouhodobá, na vysoké profesionální úrovni a podpis aktuální verze dohody vzájemnou kooperaci ještě více upevní.