V září 2017 provedla Evropská komise (EK) auditní šetření, které mělo prověřit nastavení administrativních a kontrolních postupů pro přímé platby a vybraná opatření Programu rozvoje venkova. Bylo to v době, kdy byl 11. předsedou vlády České republiky sociální demokrat Bohuslav Sobotka a zemědělství řídil přerovský rodák Marian Jurečka z KDU-ČSL. V prosinci téhož roku vydala Komise předběžnou zprávu, ve které konstatovala nedostatky v kontrolním systému některých podmínek.

Jednalo se například o několik zjištění technického charakteru: kontroly takzvaného greeningu, administrativní lhůty při podávání žádostí nebo evidování typů zemědělských pozemků. Zásadním zjištěním byl údajný nedostatek v kontrole podmínky aktivního zemědělce. Charakteristiku tohoto pojmu vysvětlíme později, bude důležitá.

Česká republika podle EK pochybila v tom, že podmínku aktivního zemědělce kontroluje pouze ve vazbě na žadatele, tedy na IČO, ale ne ve vazbě na majetkovou a personální provázanost na další subjekty a jejich ekonomické činnosti.