Zeman podle Fajta ale není schopen interpretovat podklady, které v roce 2013 dodal k profesorskému řízení. „Prezidentské rozhodnutí potvrzuje správné konstatování Nejvyššího správního soudu o tom, že prezident nemůže hodnotit meritorní kvalifikační předpoklady při udělování vědeckých titulů. Kdokoliv mimo vědeckou komunitu totiž nemusí být schopen správně interpretovat informace, které jsou jinak pro odborníky a členy univerzitních vědeckých rad běžně srozumitelné a obsahově nezaměnitelné,“ uvedl Fajt.

Za nepravdivé považuje mimo jiné Zemanovy výtky, že podle podkladů k aktuální vědecké činnosti měl být Fajt hlavním editorem devítisvazkové rukověti dějin umění středovýchodní Evropy, přičemž v době hodnocení uchazeče prokazatelně nebyl vydán ani první díl, takže šlo o „jednoznačně zavádějící informaci“. Fajt ale tvrdí, že toto dílo zcela korektně a podle zvyklostí uvedl v rubrice Ediční činnost/Ediční řady, kam náleží kontinuální, léta trvající vědecká aktivita, a nikoho tím neuvedl v omyl. Za nepravdivé označil i Zemanovo tvrzení, že Fajt neuvedl u výstavního katalogu Prague, The Crown of Bohemia hlavní editorku.

„Podobně bych mohl pokračovat ve vyvracení dalších dezinterpretací a absurdních smyšlenek, které se porůznu objevovaly a objevují, přičemž prostředí Pražského hradu při nich sehrávalo a sehrává roli iniciátora. Tyto argumenty doložím v chystané žalobě,“ uzavřel Fajt.

Prezident odmítl jmenovat Fajta a fyzika Ivana Ošťádala profesory na jaře 2015, loni mu soud věc vrátil k novému rozhodnutí, které učinil v listopadu a ve čtvrtek zveřejnil celé jeho znění. Rektor Univerzity Karlovy Tomáš Zima již dříve řekl, že škola si za svým jmenovacím řízením i oběma navrženými docenty stojí a že se pravděpodobně znovu obrátí na soud.