Velké množství účtenek, které jsou přihlášeny do Účtenkovky, se ministryni financí Aleně Schillerové zdá podezřelé. Podle jejích slov společnosti podnikají v oborech, v nichž sotva mohou k vysokým počtům dokladů přijít. Konkrétní však být Schillerová nechtěla. 

Finanční správa, která na podezřelé firmy upozornila, se zaměřila na subjekty, jež vystavují účtenky vykazující znaky fiktivních tržeb. Šlo jí zejména o haléřové účtenky. Podle Schillerové však z 34 firem uvázly jen dvě – ostatní jsou podle Schillerové naprosto relevantními obchodními modely.

Účtenkovka čelí podezření ohledně podvodů již delší dobu. Podle některých zjištění by ji mohli například zneužívat profesionální hráči posílající do slosování tisíce účtenek.