Rekonstrukci čeká v následujících měsících křížení dráhy se silnicí rovnou na pěti místech.  Z důvodu technologické náročnosti staveb je nutné, aby rekonstrukce železničních přejezdů probíhala v úplných silničních uzavírkách a nepřetržitých výlukách železničního provozu. Kvůli objízdným trasám bylo třeba pečlivě připravit harmonogram prací - a to i se zástupci přilehlých obcí, přesto stavby a nutné objížďky výrazně zasáhnou do dopravy.

Už 10. února se zhruba na 16 měsíců uzavře ulice Emilie Dvořákové v úseku mezi dopravním podnikem a ulicí Stanová. Správa železnic přemístí současnou silnici, která spojuje Trnovany s Novosedlicemi, do nového podjezdu a vybuduje přemostění ulice tak, že vlaky budou po rekonstrukci křížit ulici po mostě. Řidiči pak nebudou muset zastavovat u svěšených závor. V místě zůstane stávající podjezd pro trolejbusy.

Během stavby bude křížení uzavřené nejen pro dopravu ale i pro pěší. Chodcům nebude umožněn průchod stavbou ani přechod přes železniční přejezd, kde bude vypnuté zabezpečení a kvůli bezpečnosti pracovníků bude odpojené i trakční vedení. Vlaky budou místem projíždět plnou rychlostí. Podjezd pod tratí bude vyhrazen vozům stavby a MHD.

Nový podjezd naplánovala Správa železnic i v Důlní ulici v Sobědruhách. Práce se podařilo rozvrhnout tak, aby v době uzavírky komunikací Emílie Dvořákové a Důlní, kde se staví podjezdy, nemusel být uzavřen žádný z dalších opravovaných přejezdů. Přejezdy v Přítkovské, Zemské a Bohosudovské ulici se proto začnou opravovat, až když bude hotový podjezd v Důlní ulici. Navíc ani Přítkovská a Zemská ulice nebudou uzavřené zároveň.