Hlavní město Praha a Středočeský kraj
Ve Středočeském kraji dochází pouze k minutovým úpravám u některých vlaků na trati 174 Beroun – Křivoklát – Rakovník pro zlepšení přípojných vazeb ve stanici Beroun. Na trati 221 Praha – Benešov u Prahy dojde k nahrazení dvou starých pantografů CityElefanty, které zajistí na této trati celkem 95 % osobních vlaků.
O sobotách v období od 1. června do 31. srpna vyjede nový přímý spěšný vlak Kokořínsko. Tento vlak pojede z Prahy hl.n. v 8:06 (z Prahy-Vršovic již v 7:57), dále zastaví v Praze-Vysočanech (8:14), Čakovicích (8:27), Neratovicích (8:40), Všetatech (8:49), do Mělníka přijede v 8:59, odkud bude bez přestupu pokračovat jako osobní vlak Os 26405 jedoucí do Lhotky u Mělníka (9:23), Kaniny (9:37), Mšena (příjezd v 9:43) a dále do Mladé Boleslavi. Zpátky do Prahy do vlaku nastoupíte ve Mšeně v 16:11, v Kanině v 16:16, ve Lhotce u Mělníka v 16:29, z Mělníka vlak odjede v 16:47 a přijede do Prahy hl.n. v 17:41. Z Mělníka nebo Lhotky u Mělníka a ze Mšena jsou ve spolupráci se Sdružením obcí Kokořínska a místním autobusovým dopravcem připravovány přípoje mikrobusem k hradu Kokořín a k hradu Houska.
Pardubický kraj
Trať 010 (Praha –) Pardubice – Česká Třebová:Některé vlaky na této trati budou zastavovat ve více zastávkách: osobní vlak v 5:40 z Heřmanova Městce do Pardubic hl.n. (Os 25004) nově zastaví také v Pardubicích-Svítkově, osobní vlak v 7:37 z Kolína do České Třebové (Os 5005) v Bezpráví a spěšný vlak ve 23:41 z Pardubic hl.n. do Letohradu (Sp 1657) nově zastaví také v Dobříkově u Chocně.
Trať 015 Přelouč – Heřmanův Městec – Prachovice: Vybrané vlaky budou nově zajíždět až do Prachovic. Prodloužen sem bude o víkendech do 29. září osobní vlak z Přelouče v 16:15 (Os 25021) a nově pojedou už z Prachovic osobní vlaky v 11:12 a 17:12 (Os 25012 a Os 25026), které dosud začínaly až v Heřmanově Městci. Nabídku víkendových spojů rozšíří také osobní vlak z Přelouče v 9:15 do Heřmanova Městce, který bude až do 29. září pokračovat až do Prachovic. Osobní vlak v 10:15 z Přelouče do Heřmanova Městce (Os 25011) pojede nově pouze v pracovní dny.
Trať 016 Chrudim – Holice: Vybrané vlaky nově zastaví na zastávce Tuněchody. Půjde o vlaky z Pardubic hl.n. přes Moravany do Chrudimi v 6:45 (Os 25043), z Moravan do Chrudimi v 19:11 (Os 25055) a vlaky v opačném směru z Chrudimi v 10:18 (Os 25044) a 18:18 (Os 25050). Osobní vlaky z Chrudimi do Moravan ve 12:18 (Os 25046) a z Moravan do Chrudimi ve 13:05 (Os 25049) nově pojedou pouze v pracovní dny a nepojedou v době prázdnin.
Trať 021 Týniště nad Orlicí – Letohrad: Vybrané spoje nově zastaví na zastávce Sopotnice. Půjde o spěšné vlaky z Letohradu do Hradce Králové v 7:33 (Sp 1948) a 17:33 (Sp 1958), z Hradce Králové hl.n. do Letohradu v 9:05 (Sp 1951) a rychlík R 791 z Prahy hl.n. do Letohradu v 15:10.
Trať 238 Pardubice – Havlíčkův Brod:Osobní vlaky z Pardubic hl.n. do Chrudimi ve 13:18 (Os 5371) a z Chrudimi do Pardubic hl.n. ve 14:03 (Os 5364) nově pojedou jen v pátek mimo školní prázdniny. Tyto vlaky dosud jezdily v pracovní dny.
Trať 260 (Praha –) Pardubice (– Brno):Vybrané spoje nově zastaví na zastávce Svitavy-Lány. Půjde o spěšný vlak z Chocně do Brna hl.n. ve 14:18 (Sp 1977), osobní vlaky z Březové nad Svitavou do České Třebové ve 4:43 (Os 4760), z Letovic do České Třebové v 5:34 (Os 4762), z Ústí nad Orlicí do Letovic v 16:27 (Os 4761) a ze Svitav do Březové nad Svitavou ve 4:00 (Os 4781). Ve Svitavách-Lánech a Hradci nad Moravicí nově zastaví spěšné vlaky z Chocně do Brna ve 4:20 (Sp 1969), z České Třebové do Brna v 5:48 (Sp 1971) a 6:48 (Sp 1973) a také spěšný vlak Sp 1974 z Brna hl.n. v 15:45 do Ústí nad Orlicí.
Liberecký kraj
Trať 036 Liberec – Tanvald – Harrachov – Szklarska Poreba Górna: Víkendový vlak z Liberce (1:30) do Tanvaldu (Os 16251) od změny jízdního řádu nepojede. Vlak z Liberce do Tanvaldu s odjezdem ve 23:40 (Os 16249) pojede nově denně o 50 minut později, s odjezdem z Liberce v 0:30.
Trať 041 Turnov – Jičín – Hradec Králové hl.n.: Nově pojede v sobotu do 28. září a 5. července (kromě 6. července) osobní vlak z Turnova do Rovenska pod Troskami s odjezdem v 11:17 Jedná se o přímý vůz Praha-Vršovice – Rovensko pod Troskami od rychlíku Praha Vršovice – Tanvald (R 1140).
Trať 042 Martinice v Krkonoších – Rokytnice nad Jizerou: Od změny nepojede nedělní osobní z Jilemnice do Hrabačova s odjezdem v 5:16 (Os 15530) a zároveň nepojede v neděli osobní vlak z Hrabačova do Jilemnice s odjezdem v 6:42 (Os 15501).
Trať 064 Stará Paka – Mladá Boleslav hl.n.: Dochází pouze k časovému posunu sobotního osobního vlaku z Lomnice nad Popelkou do Staré Paky s odjezdem v 5:52 (Os 16463). Vlak pojede o 17 minut později, z Lomnice nad Popelkou s odjezdem v 6:09. Vlak ze Staré Paky do Lomnice nad Popelkou a Mladé Boleslavi v pracovní dny s odjezdem v 7:33 (Os 16404) pojede v úseku Stará Paka – Lomnice nad Popelkou o 4 minuty dříve, s odjezdem ze Staré Paky již v 7:29.
Trať 086 Liberec – Česká Lípa hl.n.: Rychlík z Ústí nad Labem do Liberce s příjezdem ve 21:31 (R 1167) pojede do 1. září denně, od 5. září pojede pouze ve čtvrtek, pátek, neděle a svátek, nepojede 28. září a 27. října. Se stejným omezením pojede i rychlík z Liberce do Ústí nad Labem s odjezdem v 18:28 (R 1168).
Plzeňský kraj
V Plzeňském kraji dojde k drobným úpravám na tratích 160 Plzeň – Blatno u Jesenice a 170 Praha – Plzeň – Cheb.
Významnější změnu ale představuje dodávka nových motorových jednotek RegioShark a jejich postupné nasazování do provozu na trati 180 Plzeň – Domažlice. Tato nová nízkopodlažní klimatizovaná souprava, která splňuje požadavky vysokého cestovného komfortu v regionální dopravě a umožňuje také Wi-Fi připojení, bude nasazena až na 29 spojích denně. Současná úprava nástupiště a zabezpečovacího zařízení na zastávce Domažlice město umožní, aby až sem bylo možné s novými soupravami zajíždět. Konkrétní obsluha zastávky Domažlice město novými motorovými soupravami bude zahájena po dokončení této stavby.
Moravskoslezský kraj
V regionální dopravě v Moravskoslezském kraji dojde jen k minimálním změnám, které se dotknou vlaků přepravujících podle průzkumů jen velmi malý počet cestujících.
Největší změny budou na trati 311 Valšov – Rýmařov, kde dochází v pracovní dny ke zrušení ranního vlaku 23501 (Rýmařov 4:00 – Valšov 4:25) a večerního 23518 (Valšov 20:20 – Rýmařov 20:44). O víkendech pak nepojede večerní vlak 23520 (Valšov 21:40 – Rýmařov 22:04). Vlak 23503 (Rýmařov 4:59, Valšov 5:24) pojede jen v pracovních dnech (dosud jezdil i v sobotu), vlak 23505 v úseku Rýmařov (6:17) – Bruntál (6:53) nepojede v neděli (dosud jezdil denně).
Na trati 310 Olomouc – Krnov – Opava nově nepojede vlak 3561 v úseku trati Valšov (4:40) – Bruntál (4:49) – jezdil v pracovních dnech.
Trať 320, úsek Bohumín – Petrovice u Karviné: U některých ranních a večerních vlaků dojde k omezení jízdy. První pár vlaků (Os 3003 z Bohumína ve 4:30 do Petrovic u K. a Os 3020 z Petrovice u K. ve 4:50 – Dětmarovice 4:57) bude jezdit nově jen v pracovní dny (dosud jezdil denně). Poslední večerní pár vlaků (Os 3007 z Bohumína ve 22:40 do Petrovic u K. a Os 3006 z Petrovic u K. ve 23:11 do Bohumína) o prázdninách nepojede (dosud jezdily v pracovní dny celoročně). V úseku Bohumín – Čadca nepojedou v neděli ráno vlaky Os 2971 (Návsí 3:44 – Mosty u J. 3:53) a Os 2920 v úseku Mosty u J. (4:00) – Návsí (4:08) – dosud jezdily denně.
V neděli ráno se týká omezení i páru vlaků na úzkorozchodné trati 298 Třemešná ve Slezsku – Osoblaha (vlaky Os 20602 z Osoblahy 5:53 do Třemešné ve Sl. a Os 20605 z Třemešné ve Sl. v 7:30 do Osoblahy).
Trať 321 Český Těšín – Ostrava – Opava: Spěšný vlak Sp 1618 (Ostrava-Svinov 20:16 – Opava východ 20:40) pojede nově jen v pátek, sobotu a neděli (dosud jezdil denně). U osobního vlaku Os 3434 (Český Těšín 19:43, Ostrava-Svinov 20.30-20.49, Opava východ 21.21) bude nutné ve stanici Ostrava-Svinov v pondělí až čtvrtek přestoupit. Ranní spěšný vlak Sp 1603 z Opavy východu v 5:42 do Ostravy-Svinova nově zastaví ve Štítině (5:48), z Opavy proto bude odjíždět o minutu dříve (5:41).
Ke zlepšení cestování v integrovaném dopravním systému Moravskoslezského kraje mezi Bohumínem a Suchdolem nad Odrou přispěje možnost použití rychlíků R 732 (Bohumín 6:30 – Suchdol n.O. 7:05), R 741 (Suchdol n. O. 16:58 – Bohumín 17:33) a 747 (Suchdol n.O. 22.58 – Bohumín 23.33) na jízdní doklad ODIS.
Olomoucký kraj
Na trati 271 Prostějov hl.n. – Dzbel dochází ke změně časových poloh prvních ranních vlaků v obou směrech. Osobní vlak do Prostějova, který nyní ze Dzbele odjíždí ve 4:12 odjede ze Dzbele ve 4:23 a do Prostějova hl.n. dojede v 5:11. V opačném směru osobní vlak s odjezdem s Prostějova hl.n. ve 4:40 odjede již ve 4:23 a do Dzbele dojede v 5:25 hod. Důvodem změny časových poloh je požadavek cestujících na pozdější příjezd vlaku do Prostějova..
Trať 290 Olomouc – Šumperk: Osobní vlak z Olomouce hl.n. v 6:57 nepojede v sobotu a neděli. Večerní vlak z Olomouce hl.n. ve 21:37 pojede i v období hlavních školních prázdnin, tj. v pracovní dny od 1. července do 30. srpna.
Trať 292 Šumperk – Krnov: Všechny spěšné vlaky relace Jeseník – Krnov nově zastaví na znamení v obou směrech na zastávce Hradec-Nová Ves. Rovněž na zastávce Česká Ves bazén zastaví všechny vlaky pouze na znamení.
Jihomoravský kraj
V regionální dopravě na jižní Moravě proběhne několik pozitivních změn. Dochází k rozšíření víkendové dopravy odpoledne z Moravských Bránic do Ivančic a Bohutic. V sobotu a neděli pojede z Mor. Bránic do Bohutic vlak v 12:29, do Ivančic v 13:31 a dále v sobotu vlaky v 14:29, resp. 15:31, včetně protiběhů zpět do Mor. Bránic. Ze Znojma bude možné cestovat nově v sobotu v 5:58 směrem na Břeclav. Z Tišnova vyjede v 7:00 v sobotu nový vlak do Brna, svoji jízdu ukončí na zastávce Brno-Lesná.
V pracovní dny dojde k rozšíření železniční dopravy na trati Šakvice – Hustopeče u Brna, nově pojedou ze Šakvic vlaky ve 20:03 a 21:03, zpět z Hustopečí v 20:44 a 21:37. Drobnými časovými úpravami projdou dva večerní osobní vlaky z Letovic do Brna s cílem navázat v Brně-Židenicích přípoj na vlaky směr Tišnov. V pracovní dny nově pojedou osobní vlaky z Hodonína do Břeclavi (16:43 a 20:02) a z Břeclavi (22:35) do Hodonína. Z Veselí nad Moravou do Kyjova pojede osobní vlak v 18.25 a jeho protiběh z Kyjova (19:08) i od pondělí do středy.
Na trati Bzenec – Moravský Písek vyjíždí v současné době v neděli první vlak po 13. hodině, od změny jízdního řádu bude zajištěna nedělní doprava již po 9. hodině. Na železničním přechodu Vrbovce nabídneme společně se slovenským dopravcem ZSSK zlepšení obslužnosti. Osobní vlaky z Veselí nad Moravou v 7:00 (jede o víkendech) a celotýdenně v 9:03 a 11:03 budou z Javorníka nad Veličkou pokračovat do Vrbovců, zpět z Vrbovců v 8:31 (o víkendech), 10:31 a 12:31.
Kraj Vysočina
Změny očekávané na území Kraje Vysočina jsou zcela minimální. Na trati 250 Brno – Havlíčkův Brod (–Praha) dojde k časovému posunu vlaku Os 14825 Havlíčkův Brod – Žďár nad Sázavou o 6 min. do pozdější časové polohy (původně odjezd 18:56, nově 19:02). Vznikne tak nový přípoj od rychlíku R 911 Praha – Jihlava.
Na druhou stranu dojde ke zrušení „Nostalgických a výletních vlaků“ na tratích Kostelec u Jihlavy – Slavonice (tyto pravděpodobně převezme nový provozovatel) a na trati Havlíčkův Brod – Žďár nad Sázavou – Nedvědice (akce „Slavnosti Pernštejnského panství“).
Zlínský kraj
Ve Zlínském kraji dojde pouze několika drobným úpravám.
Trať 282 Vsetín – Velké Karlovice: Osobní vlak ze Vsetína do Velkých Karlovic ve12:32 (Os 13263), který jezdil denně, pojede o sobotách do 7. září o 27 minut později, tj. ze Vsetína ve 12:49.
Trať 303 Kojetín – Valašské Meziříčí: Osobní vlak s odjezdem z Kroměříže do Holešova v 19:14 (Os 3947) pojede v úseku Kroměříž – Hulín nově také o sobotách.
V regionální železniční dopravě v Jihočeském, Karlovarském a Královéhradeckém kraji nebudou od 9. června žádné zásadní změny.