Sobotka se v Mnichově sejde s bavorským zemským premiérem Horstem Seehoferem, který se v prosinci 2010 svou návštěvou Česka postaral o prolomení diplomatických ledů. Obě sousední země po desetiletí rozděloval názor na poválečné dějiny a vysídlení sudetských Němců z Československa – většina z nich se usadila právě v Bavorsku. S bývalým premiérem Petrem Nečasem se Seehofer dohodl, že otázky minulosti už nebudou zatěžovat vzájemné vztahy.

Jedním z hlavních témat jednání Sobotky se Seehoferem bude modernizace železničního spojení Česka a Bavorska. V současnosti je trať spojující Prahu s Mnichovem jednokolejná a není elektrifikovaná. Cesta mezi oběma městy tak trvá šest hodin, po modernizaci by ji podle dopravních expertů bylo možné zkrátit o čtvrtinu.

Jednat se bude i o bavorsko-české zemské výstavě

Premiéři se rovněž budou zabývat připravovanou bavorsko-českou zemskou výstavou. Ta se uskuteční v roce 2016 v Praze a Norimberku a jejím ústředním tématem bude osobnost českého a německého krále a císaře Karla IV.

Sobotka v Mnichově také vystoupí na semináři zaměřeném na propojování hospodářství a vědy a výzkumu. Zájem Prahy na posílení spolupráce s Bavorskem v této oblasti dokládá i to, že Sobotku doprovází vicepremiér pro vědu a výzkum Pavel Bělobrádek. Ten bude v Mnichově jednat o bavorských zkušenostech s podporou aplikovaného výzkumu a o možnostech převedení pozitivních zkušeností i do českého prostředí.

Sobotka v Bavorsku rovněž navštíví místnost, v níž byla v roce 1938 podepsána Mnichovská dohoda o odstoupení tehdejších Sudet nacistickému Německu a faktickém rozbití Československa. Premiér také uctí památku protinacistické odbojové skupiny Bílá růže a navštíví mnichovské Dokumentační centrum nacismu, které připomíná zločiny tohoto režimu.