Komárkovi podle HN nikdo neprokázal, že při podpisu kontraktu věděl o tom, že ceny ve smlouvě neodpovídají aktuálním tržním cenám. Bývalému řediteli prý pomohlo i to, že v zákoně o SŽDC, ani ve vnitřních předpisech, nic řediteli organizace nepřikazuje, aby s jejím majetkem hospodařil zodpovědně.

Loni v listopadu dostal Komárek u Obvodního soudu pro Prahu 1 dvouletý podmíněný trest. Protože se odvolal, případem se proto zabýval Městský soud v Praze. Komárek podle obžaloby v prosinci 2008 jako generální ředitel SŽDC uzavřel smlouvy na dodávky elektřiny na roky 2010 a 2011, přestože věděl, že ceny ve smlouvách neodpovídají tržním cenám. Cena elektřiny mezi 13. listopadem, kdy byla vybrána jedna z nabídek, do 19. prosince téhož roku, kdy byla smlouva podepsána, na burze klesla. Cena elektřiny, která byla sjednána jako fixní, tak prý byla ve smlouvě na rok 2010 předražena nejméně o 201 korun za megawatthodinu, ve smlouvě na rok 2011 pak nejméně o 181 korun. Škoda nebyla způsobena díky tomu, že společnosti České dráhy a ČD Cargo, kterým měla SŽDC energii prodávat, s ní smlouvy nakonec neuzavřely. Někdejší dlouholetý ředitel vinu od počátku odmítá. U soudu se již dříve hájil tím, že neměl o cenách na burze přehled.