V aktuálně vydávané první části EU reportu hodnotí NKÚ stav čerpání prostředků poskytovaných z fondů EU do ČR v programovém období 2014–2020. NKÚ informuje také o tom, jak ČR z pohledu EU pokročila při plnění doporučení, která jí uložila Rada Evropy na rok 2016, a jak se jí dařilo v jednotlivých oblastech plnit národní program reforem na rok 2016.

NKÚ se ve své zprávě věnuje také oblasti příjmů rozpočtu a daňové regulaci v ČR v kontextu příjmů a daňové regulace EU. Zaměřuje se na oblasti daně z přidané hodnoty, spotřebních daní a daně z příjmů. Ve zprávě popisuje také aktuální vývoj v oblasti daňové legislativy. NKÚ srovnává svá zjištění z kontroly příjmů rozpočtu se zjištěními Evropského účetního dvora. Věnuje se také otázce boje proti příjmovým podvodům na úrovni EU.

Hospodaření s prostředky z evropských fondů v ČR hodnotí NKÚ podle jednotlivých výdajových oblastí. Oblast politiky hospodářské, sociální a územní soudržnosti, která je z hlediska výdajů nejvýznamnější, prověřil NKÚ v roce 2016 celkem v sedmi kontrolách. Poukázal na nedostatky jak v řídicím a kontrolním systému, tak u jednotlivých projektů.

NKÚ dále ve zprávě analyzuje nízký stav čerpání alokovaných prostředků z této oblasti v aktuálním programovém období. K 31. březnu 2017 dosáhly žádosti o průběžnou platbu odeslané Evropské komisi 16,6 miliardy korun, tedy pouze 2,7 % alokace bez tzv. výkonnostní rezervy. Zařadili jsme se tak mezi nejméně čerpající členské státy EU.1 Hospodaření i čerpání prostředků v kontextu svých kontrol popisuje NKÚ rovněž u oblasti společné zemědělské politiky a společné rybářské politiky EU. Svá zjištění ze všech uvedených oblastí pak NKÚ srovnává se závěry Evropského účetního dvora.

V období od dubna 2016 do 31. března 2017, kdy měl EU report redakční uzávěrku, ukončil NKÚ celkem 11 kontrol zaměřených na prostředky s vazbou na rozpočet EU.