Evropský nejvyšší žalobce bude zejména organizovat práci Úřadu, řídit jeho činnost a zastupovat Úřad ve vztahu k orgánům Evropské unie, jejím členským státům a třetím stranám. Funkční období bude sedmileté, bez možnosti jej obnovit. Evropský nejvyšší žalobce bude sídlit v Lucemburku.

Zatímco tedy evropský nejvyšší žalobce bude vybírán ve výběrovém řízení vyhlášeném Evropskou komisí, evropští žalobci (jeden za každý zúčastněný členský stát) budou vybírání ve dvou fázích. Vláda na konci října letošního roku schválila pravidla, podle kterých budou za Českou republiku na základě výběrového řízení ministrem spravedlnosti vybráni tři kandidáti. Jeden z nich pak bude jmenován do funkce Radou EU na základě doporučení odborné komise. Konečně evropští pověření žalobci, kteří budou bezprostředně působit v jednotlivých zemích, budou v České republice vybírání prostřednictvím výběrového řízení vyhlášeného nejvyšším státním zástupcem a následně jmenováni do funkce kolegiem evropských žalobců.

Výběrové řízení na evropského žalobce za Českou republiku bude vyhlášeno do 31. prosince 2018.